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宝马5系报告电动冷却液泵缺失和宝马3B99故障码电动冷却水泵缺失的问题，通常与冷却系统的电气元件有关。这些问题可能是由于以下几个原因导致的。
1、冷却液泵故障：电动冷却液泵可能发生故障，导致无法正常工作，这可能是由于泵本身的问题，如电机损坏或电路故障。
2、电路问题：电动冷却液泵的电路可能存在问题，导致无法正确接收信号或供电，这可能是由于电路断路、短路或连接不良等问题引起的。
3、软件或控制模块问题：在某些情况下，车辆的软件或控制模块可能出现问题，导致无法正确识别或控制电动冷却液泵。
为了解决这个问题，建议采取以下步骤：
1、诊断故障代码：使用专业的诊断工具读取车辆的故障代码，以确定问题的具体来源，故障代码可以提供关于哪个部件或系统出现问题的信息。
2、检查电动冷却液泵：检查电动冷却液泵的外观是否有损坏或异常，如果发现异常，可能需要更换泵。
3、检查电路：检查电动冷却液泵的电路，确保电路正常连接并且无损坏，如果发现电路问题，可能需要修复或更换相关部件。
4、更新软件或控制模块：如果诊断结果表明问题与控制模块或软件有关，可能需要更新车辆的软件或重新编程控制模块。
这些步骤需要专业的技术和知识，建议将车辆送到专业的汽车维修店进行检查和维修，确保使用正确的配件和遵循制造商的维修指南，以避免对车辆造成进一步的损害。